在做meta分析时，对于计数资料有OR、RR、RD等效应指标可供选择。OR、RR、RD这些指标的选择依赖于文献的结局变量是什么指标。OR是优势比，RR是相对危险度，RD是率差，这三种指标的选择需根据具体的专业问题来选择。在处理组阳性率比较小时，OR和RR差别不大；RR是在两个率都不太小时使用。
在对OR、RR、RD等进行分析时，Mantel-Haenszel可以使用；Peto法适用于结局变量是OR的资料，该法计算较为简单，但一般认为，OR均大于5或小于0.2时，或四格表数据很不平衡时，计算结果不理想；Fleiss法也可于OR值的计算（在只是已知各种率时使用）；广义的基于方差的方法选用于对RD和RR的分析。
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